El ascenso a la liga ASOBAL, el más importante logro del deporte antequerano en su historia, llena de alegría y euforia a una afición que se entrega con su equipo en una temporada difícil, la de su debut en la categoría de oro del balonmano nacional. Sin embargo, pronto empiezan las dificultades. La andadura del club, lastrada por el pésimo calendario que le correspondió en suerte, es preocupante. Así, se llega al final de la primera vuelta con el equipo en última posición con solo seis puntos.
La amenaza del descenso rondaba por el remozado Fernando Argüelles, pero una sensacional segunda vuelta, hace que el equipo llegue con opciones de salvación a la última jornada en la que juega en Almería. Allí, tras un memorable desplazamiento masivo de la marea verde, y en un partido tenso, vibrante, nervioso y difícil, el BM. Antequera confirma su permanencia tras derrotar a los almerienses por 24 - 27.
BM Antequera - FC Barcelona Temporada 2006-2007Los equipos de base por su parte también firman una gran temporada. El segundo equipo, que debutaba en segunda división logra con holgura y brillantez su objetivo de permanencia, mientras que los juveniles de Primera División Andaluza, se proclaman Campeones de Andalucía, son primeros en la fase de clasificación para el Campeonato de España celebrada en Antequera, y acaban séptimos en la fase final de dicho Campeonato. Por su parte, los juveniles de Segunda División, se proclaman campeones de la misma y logran el ascenso a la Primera División Andaluza.
En la temporada 2007-2008, el club inicia su segunda temporada en la máxima categoría con una idea clara: este debía ser el año de la consolidación. Con esa idea en mente y tras un comienzo un tanto dubitativo, el equipo alcanza un gran nivel de juego y consigue derrotar durante la primera vuelta a tres de los "grandes". CAI Aragón, Portland San Antonio y Valladolid, estos dos últimos a domicilio, son derrotados por primera vez por nuestro equipo, que finaliza la primera vuelta con dieciséis puntos y una mas que meritoria octava posición en la tabla que le vale, por primera vez en la historia su clasificación para la Copa del Rey que se celebraba en Zaragoza.
La disputa de esta fue sin duda el momento culminante de la temporada. Emparejados con el BM Ciudad Real, a la postre campeón del torneo, su partido de cuartos de final fue objeto de un desplazamiento masivo, otra vez, de la marea verde que incluso llenó un AVE especialmente fletado para acudir al evento. Aunque el resultado fue adverso, ese día pasó a la historia del deporte antequerano y quedará por muchos años en la memoria de los aficionados.
Copa del Rey 2008. Equipo y AficiónLos equipos de la base por su parte, volvieron a dar la cal y mientras los cadetes conseguían el tercer puesto en la mini-copa del Rey y el 7º puesto absoluto en el Campeonato de España, los infantiles iban un poco más allá y tras conseguir el Campeonato de Andalucía de su categoría, terminaban por hacerse con el quinto puesto en el Campeonato de España.
| Renovalia C. Real | 0 |
| FC Barcelona | 0 |
| C. Rayas Valladolid | 0 |
| Reale Ademar | 0 |
| Naturhouse La Rioja | 0 |
| Amaya San Antonio | 0 |
| CAI BM Aragón | 0 |
| Fraikin Granollers | 0 |
| BM. Alcobendas | 0 |
| Cuenca 2016 | 0 |
| e-gim Antequera | 0 |
| BM. Torrevieja | 0 |
| J.D. Arrate | 0 |
| Toledo BM | 0 |
| Alser P.Sagunto | 0 |
| Quabit Guadalajara | 0 |